永续合约没有到期交割环节，结算主要分为平仓盈亏结算、周期性资金费用结算，部分平台还支持时段盈亏结转结算，不存在到期强制现金交割，仓位可以长期持有，结算动作不会改变持仓数量。
绝大多数主流交易所采用8小时周期执行资金费用结算，固定在每日三个时间点触发，这也是永续合约最核心的结算行为，结算并非交易所收取手续费，而是多空持仓用户之间互相划转资金。资金费率为正时，多头向空头支付资金费用；资金费率为负，则空头向多头支付，资金费用直接从合约账户余额完成扣减或者发放，只要在结算时间点持有仓位就会参与本次结算，中途开仓、结算前平仓则不会产生本次周期的资金费用。很多交易者容易混淆成交价与标记价格，资金费用结算以当期最终资金费率为准，和盘中合约涨跌没有直接关联，极端行情下平台也有可能临时调整结算周期，用来缩小合约与现货指数之间的基差。
平仓结算是最常见的结算形式，不管是手动平仓、止盈止损触发平仓还是系统强制平仓，一旦仓位完全了结，未实现盈亏就会转化为已实现盈亏，扣除交易手续费、累计资金费用之后，最终净收益会划入合约账户余额。全仓模式下结算所得资金直接进入合约账户可用余额，可以直接用于新开仓位或者划转转出；逐仓模式中，平仓结算后的盈亏只会归入该仓位对应的隔离保证金，仓位关闭之后剩余资产才会释放回账户。需要注意，未平仓状态下的浮盈属于未实现盈亏，只是账面收益，只有完成平仓或者平台开启时段结转机制，浮盈才会真正变为账户可支配余额，单纯持有仓位不会自动把浮动盈利结算到余额。
标记价格贯穿永续合约结算与风控的全过程，计算未实现盈亏、判定强平门槛都使用标记价格，而非盘口实时成交价，目的是规避短时插针、恶意砸盘带来的异常结算与无辜爆仓。标记价格综合现货指数价格、基差、资金费率预期共同计算，和合约成交价格会存在小幅偏差，这就会出现盘面合约价格已经盈利，但标记价格计算依旧处于浮亏的情况，用户看到的界面浮盈浮亏全部基于标记价格生成，结算环节也以这套公允价格体系作为计算基准，并不是以订单成交价格直接判定盈亏结果。当保证金低于维持保证金标准触发强平时，系统会优先在市场撮合平仓，平仓完成后立刻执行结算，亏损部分优先消耗保证金，如果出现穿仓缺口，会由保险基金承接，部分平台配套ADL自动减仓机制，避免亏损分摊给普通交易者。
不少新手会拿交割合约的思维理解永续合约结算，交割合约到期会强制全部平仓并按指数价格完成一次性交割结算，永续合约没有这个流程，只要保证金充足，仓位可以跨星期、跨月份持续持仓，需要持续承担每周期的资金费用成本。部分平台推出的时段结算功能，会跟随资金费用周期，把当前未平仓仓位的浮盈结转为已实现盈亏计入余额，但持仓本身继续保留，开仓均价会更新为当期标记价格，这种机制可以把浮盈释放出来继续开仓放大资金利用率，但并不会改变仓位本身的风险，浮亏仓位不会因为时段结算而消失，风险依旧跟随市场价格持续变动。交易实操当中，持仓用户需要重点盯紧结算时间，高杠杆状态下，一笔大额资金费用扣减，就有可能压低保证金率，间接触发强制平仓，这也是合约交易中容易被忽视的风险点。
